序：　「イノベータ日本」とわが国の技術の方向
１章 イノベーションとは
1-1　イノベーションを誘発する国家システム（JST・生駒俊明）
1-2　Ｒ＆ＤからＲ＆Ｉへ（産総研・池上徹彦）
1-3　イノベーションに対する国の取組み（JST・井上孝太郎）
２章 イノベーションの現場
2-1　新しい半導体生産技術の創出（東北大学・大見忠弘）
2-2　HDDのイノベーション（東北大学・中村慶久）
2-3　イノベーションとしての液晶（シャープ・船田文明）
2-4　日本の複写機産業が世界を制した理由（リコー・酒井　清）
2-5　チームワーク・異分野融合・そして独創開発（島津製作所・田中耕一）
2-6　医薬品産業におけるイノベーションと知的財産（武田薬品・秋元　浩）
３章 シーズとニーズの出会い
3-1　組織能力とアーキテクチャ（東京大学・藤本隆宏）
3-2　研究開発システムのイノベーション（ATR・畚野信義）
3-3　アメーバ的ネットワークのすすめ（京都大学・平尾一之）
3-3a　大容量DVD用集光機能性ナノガラス薄膜の開発（日立製作所・山本浩貴）
3-3b　ナノ構造結晶化ガラスの開発（日本電気硝子・坂本明彦）
3-4　イノベーションの創出に向けた産業界の見解（日本経団連・笠見昭信）
４章 知と価値創造の結合パイプライン網の構築（総合科学技術会議議員・柘植綾夫）
跋：「イノベータ日本」達成に向けて
付録
・第3期科学技術基本計画の概要
・イノベーション創出総合戦略の概要